云南省保健康复中心（原云南省干部疗养院）成立于1953年，2019年，根据《中共云南省委机构编制委员会办公室关于印发〈云南省卫生健康委员会所属事业单位机构编制方案〉的通知》（云编办〔2018〕230号），云南省干部疗养院更名为云南省保健康复中心，隶属云南省卫生健康委员会，公益二类事业单位。主要职责为承担干部医疗保健、健康管理、医疗康复、职业病疗养、驻地社区卫生、省级“医养结合”以及面向南亚东南亚国际养老养生中心和健康医疗旅游合作中心项目建设等工作任务。

共设置有8个职能科室，即中心办公室（含信息办、法治办、外事办）、党委办公室（含信访办）、纪委办公室、人事科（含绩效办）、财务科（含医保办）、医务科、总务科、采供科；7个业务科室，即康复医学科（含睡眠障碍康复专科、体检科、卫生院、康复治疗室、康复评定室）、中医科、保健一科、保健二科、膳食科、药械科、外联科。